首先，玩家会出现在未白镇的一辆小货车里。下车后看到了老妈，看样子是到新家了。妈妈让玩家上楼去调整时钟。调好后从旁边的电脑里取出伤药，之后下楼。出门后受妈妈之托拜访主角爸爸的朋友小田卷博士之家，就在隔壁。来到研究所，博士不在。到楼后调查一个精灵球，玩家的对手就会出现。对话后走出房子，往上离开未白镇时，发现博士正被一只蛇纹熊追赶。
博士让玩家在旁边的背包里选择一只精灵参加战斗，赶跑蛇纹熊。跟博士回研究所，送主角火稚鸡并帮忙找女儿。穿过101号道路就是古辰镇了，古辰镇上方是103号道路，在这里可以见到女主。在这里击败对手后，回到未白镇的研究所，博士会送玩家图鉴，对手也会给玩家5个精灵球。
离开研究所，妈妈还会送玩家跑步鞋。穿过102号道路来到橙华市，先去上方的训练馆。馆主是玩家的爸爸，对话的时候会出现一个叫小光的绿头发男孩。帮他抓完拉鲁拉丝后，爸爸会告诉玩家，让玩家收集4枚徽章后再来这里挑战。
104号道路的上方是橙华森林。在前进的途中会遇到得文公司的一名职员，他被水舰队的一名小兵拦截了。击败小兵后会获得一个超级球。走出森林，还是104号道路，在这里的一间屋子里可取得吼吼鲸喷壶。（吼吼鲸喷壶是可以使植物种子生长，但若是玩家的游戏版本不分白天黑夜，那种了也是白种，纯属浪费……）。
继续前进，抵达卡那兹市。
【卡那兹市训练馆】
PC中心隔壁的房子可以获得HM01一字斩，接下来就要去挑战道馆了。
馆主：杜鹃 岩属性 【如果是火主推荐练到16级再打，用2连踢】
走出训练馆，会遇到刚才的职员与小兵。
从106道路出发到达卡绿隧道。
在最右边有条隧道，洞口有个老头说他的长翅鸥被水舰队的人抢走了。进去后会看到刚才的小兵和长翅鸥，击败他后会得到一个超级球，把长翅鸥还给老头后就可以回卡那兹市了。
找到刚才的职员，他会带玩家到得文公司找他的BOSS，BOSS会送玩家一个导航机，还让玩家给一个正在武斗镇、叫大吾的人送信。
之后在卡那兹市下方会遇到对手，他会向玩家挑战。
回到橙华森林下面的无人小屋，跟刚才的老头对话，他会送玩家到武斗镇。
【武斗镇训练馆】
刚到武斗镇就可以获得钓竿。
然后就可以挑战道馆了，此处道馆起初为一小块可见度，随着打败道馆内的训练家，可见度慢慢扩大。
馆主：藤树 格斗属性 【这里推荐去抓一只勾魂眼来打】
挑战完毕后往西北走，有个山洞，进去后跟里面的矿工对话可得到秘传机05闪光。
往洞内深处走（需要闪光）碰到大吾，把信给他后会得到招式机47钢翼。
之后如果回到得文公司找BOSS还会得到学习装置。再去找那个老头，他会送玩家去凯那市。
刚到达凯那市，会发现在水族馆门前有许多水舰队的人。
在下方的造船厂二楼跟一名老伯对话后，就可以进入水族馆了。在二楼击败两名小兵后即可离开凯那市。
在110号道路会遇到对手
击败他后可获得探宝仪。继续前进可到达紫堇市。
【紫堇市训练馆】
在训练馆门前会遇到小光，跟他对战后才可以进入训练馆。
馆主：铁旋 电属性 【这里最好练一只小拳石，地震很方便，或者用沼跃鱼的泥浆喷射】
Lv20Lv20Lv22Lv24
在精灵中心右边的屋子里可获得一辆自行车，有快速自行车和跳跃自行车两种，分别有不同的功能，以后可随时来换车。
在右下角的屋子里可获得秘传机06碎岩。
往左走是117号道路，这里有饲养屋，可放精灵到这里生蛋。继续前进就到绿荫镇了。
在绿荫镇的上方有条隧道，把路上的岩石用碎岩劈掉后可获得秘传机04怪力。
回到紫堇市，(往右走，有一个小沙滩，朝沙滩上的一块岩石上一点，就可以找到东西)往上走来到111号道路，这里有竞速塔，上方是沙漠地带，暂时还不能进去。
往左走，在112号道路那里有一条火之捷径，走过去后发现已经穿过了沙漠地带。
继续前进，穿过113号道路后来到秋叶镇。
秋叶镇的左边是114号道路，继续前进会到达流星瀑布。
在流星瀑布里面会遇到水舰队和火岩队的人，对话后得知他们正在争夺一颗化石。
之后回到112号道路，在火之捷径的旁边有缆车，乘坐缆车即可到达凹凸山的山顶（下车后向右上走，那个黄色的两个一组的横格为楼梯，由此再向上）。
击败火岩队的首领后可取得化石，之后可回秋叶镇把化石交给之前在流星瀑布里的那名研究员。
下山后可来到釜炎镇。
挑战道馆主 馆主：亚莎 火属性 【这里推荐抓一只玛力露来打】
Lv24Lv24Lv26Lv29
走出训练馆会遇到对手，他会给玩家一个躲避沙尘暴的道具，以后就可以去沙漠了。（注：在沙漠里有一座时有时无的虚幻塔，在里面可捡到一块化石。）
【橙华市训练馆】
现在已经收集够4枚徽章了，回到橙华市，向爸爸发出挑战。
馆主：千里 普通属性 【这里要靠等级压制，或者就用勾魂眼】
Lv27Lv27Lv29Lv31
打败爸爸后，小光的爸爸会出现，并送玩家秘传机03冲浪。
获得5枚徽章后，玩家经过卡绿隧道再次来到紫堇市，在右边使用冲浪来到118号道路，在这里会遇到大吾。
往上走是119号道路，这里有高草，只能走路前进。
在119号道路的最上方，有一间气象台，里面被水舰队占领了。
击败二楼的Boss后，气象台所长会送玩家一只漂浮泡泡。
出气象台，过桥后会遇到对手，打倒她后会得到秘传机02飞天。
【茵郁市训练馆】
继续前进来到茵郁市。茵郁市的训练馆门前不知有什么东西挡住，无法进去，只好继续赶路。
在120号道路的桥上会再次遇到大吾，他告诉玩家那种透明的东西是变隐龙变的，并给玩家一瓶可令变隐龙显身的喷雾剂，让玩家击败或收服前面的变隐龙（30级）。解决它，大吾将观测镜送给你，这样就可以去挑战道馆了
回到茵郁市，对训练馆门前的变隐龙使用喷雾剂即可进去。
馆主：娜琪 飞行属性 【首先去114号道路冲浪抓一只水跃鱼，练高一点去用急冻光线可以很轻松】
Lv29Lv29Lv30Lv31Lv32
继续前进，在121号道路会遇到火岩队的人，来到水静市后发现城市已经被水舰队占领。
在上方的百货大楼门前会看到对手，在这里可与对手进行联盟比赛前的最后一次比赛打败他后，他就飞回家去了。
在水静市最右边，发现入海口被吼吼鲸封锁，从水舰队的小兵口中得知火岩队大军压至落日山。
回水静市通过小道消息打听到在凹凸山异常现象（不打听也可进入剧情），立即飞往釜炎镇，坐缆车上山。上到山顶后往下走（直接去乘缆车上去，然后在向下去釜炎镇在路上就会出现洞口进去就可以进行剧情了），会有一阵地震，之后在山腰上会出现一个山洞，里面就是火岩队的秘密基地。
在深处遇到火岩队首领，固拉多也在那里。对话后要与首领对战。
赤焰松：Lv37Lv38Lv39
【绿岭市训练馆】
之后飞到凯那市，在上方的船厂里发现潜水艇被水舰队盗走。
飞回水静市，在右上方的水域里可进入水舰队的秘密基地，在深处发现水舰队的首领已坐着潜水艇逃走。另外，在这个基地里还可捡到一个大师球。
离开秘密基地，往右穿过124、125号水路，即可来到绿岭市。
先来挑战道馆，是对双胞胎。
